{"id":1390,"date":"2013-01-22T10:05:15","date_gmt":"2013-01-22T09:05:15","guid":{"rendered":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/?p=1390"},"modified":"2013-01-22T10:05:15","modified_gmt":"2013-01-22T09:05:15","slug":"chercher-le-faux-pour-trouver-le-vrai","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/2013\/01\/22\/chercher-le-faux-pour-trouver-le-vrai\/","title":{"rendered":"Chercher le faux pour trouver le vrai"},"content":{"rendered":"

J’ai pris pas mal de retard dans ma veille bibliographique, j’en suis r\u00e9duit \u00e0 lire le JAMA de mercredi dernier, aujourd’hui. J’y ai d\u00e9couvert un point de vue<\/a> tr\u00e8s int\u00e9ressant.<\/p>\n

    \n
  1. Prasad V, Jena AB. \u00ab\u00a0Prespecified falsification end points: Can they validate true observational associations?\u00a0\u00bb JAMA<\/i> 309, no<\/sup> 3 (janvier 16, 2013): 241\u2011242. doi:10.1001\/jama.2012.96867.<\/li>\n<\/ol>\n

    Les \u00e9tudes observationnelles sont indispensables pour identifier des associations difficilement accessibles \u00e0 l’essai randomis\u00e9 en double aveugle. En pharmacovigilance, elles sont utiles pour identifier les \u00e9v\u00e9nements secondaires rares d\u00e9finis par une fr\u00e9quence inf\u00e9rieur \u00e0 1\/1000. L’\u00e9norme probl\u00e8me, que tout le monde connait, est l’impossibilit\u00e9 de d\u00e9finir un lien de causalit\u00e9 avec une \u00e9tude observationnelle, on d\u00e9crit une association. Si l’association peut \u00eatre expliqu\u00e9e par un raisonnement scientifique \u00e9tay\u00e9 par les donn\u00e9es actuelles de la science, nous avons tendance \u00e0 la retenir et parfois y voir un lien de causalit\u00e9. J’insiste, une \u00e9tude observationnelle ne permettra de mettre en \u00e9vidence qu’une association. Quand la suspicion est forte et que le risque d\u00e9passe le service rendu, il est l\u00e9gitime par principe de pr\u00e9caution d’arr\u00eater l’utilisation de la mol\u00e9cule ou au moins de la limiter.<\/p>\n

    Nous entrons dans l\u2019\u00e8re du Big Data en m\u00e9decine<\/a>. Gr\u00e2ce \u00e0 l’informatisation des les flux informationnels et le d\u00e9veloppement des outils logiciels, il devient de plus en plus facile de tester des associations dans des volumes de patients importants. Le risque de ce jeu est bien connu. Plus on multiplie le nombre de tests statistiques plus la chance de trouver une fausse association significative est importante. Avec un p \u00e0 0,05, ce sera une association test\u00e9e sur 21 qui sera positive, simplement du fait du hasard. Pour aller plus loin, je vous conseille l’explication par l’ami jean marie \u00e9clairer par XKCD et ses dragibus<\/a>. Quand vous faites ce genre d’analyse vous devriez vous limiter \u00e0 tester des associations\u00a0 pr\u00e9 sp\u00e9cifi\u00e9es ayant un sens biologique. C’est la th\u00e9orie, en pratique on met tout dans la machine et on mouline jusqu’\u00e0 trouver quelques choses de publiables avec un rationnel (bad statistics). Trouver un rationnel \u00e0 une association m\u00eame improbable n’est pas tr\u00e8s difficile avec un peu d’imagination et Pubmed.<\/p>\n

    M\u00eame si vous \u00e9vitez la torture de donn\u00e9es<\/a>, m\u00eame si vous faites des corrections pour les hypoth\u00e8ses multiples, vous n’\u00eates pas \u00e0 l’abri d\u2019identifier un effet secondaire rare qui n’existe pas. Ceci a des implications importantes pour l’industriel mais aussi pour les patients.<\/p>\n

    Les auteurs de ce point de vue propose une d\u00e9marche originale, l’utilisation de crit\u00e8res d’\u00e9valuation faux pr\u00e9 sp\u00e9cifi\u00e9s. L’id\u00e9e est de d\u00e9terminer des crit\u00e8res d’\u00e9valuations qui sont faux de fa\u00e7on \u00e9vidente, par exemple est ce que la consommation de parac\u00e9tamol est associ\u00e9e \u00e0 l’apparition d’une douleur du petit orteil droit (c’est un mauvaise exemple car peu fr\u00e9quent, il vaut mieux prendre des douleurs articulaires en g\u00e9n\u00e9ral). Il en faut quatre ou cinq, pas plus et les tester avec les m\u00eames m\u00e9thodes statistiques que les hypoth\u00e8ses que nous imaginons avoir du sens. L’id\u00e9al est d’avoir en plus un effet secondaire connu explorable dans la cohorte, par exemple pour un antiaggr\u00e9gant l’augmentation du risque de saignement digestif. Si vos faux crit\u00e8res d’\u00e9valuation ne sont pas associ\u00e9s \u00e0 la prise\u00a0 m\u00e9dicamenteuse, si l’effet secondaire connu est bien pr\u00e9sent dans le groupe des expos\u00e9s, votre effet inattendu associ\u00e9 \u00e0 la prise du produit a de bonnes chances d’\u00eatre vrai. Il n’y a pas de lien de causalit\u00e9 mais vous renforcez la validit\u00e9 de l’association.<\/p>\n

    Les auteurs citent comme exemple un de leur travail sur l’association IPP- pneumonie, pour montrer que malgr\u00e9 un rationnel scientifique coh\u00e9rent, elle est probablement fausse du \u00e0 des facteurs confondants. Il avait pris comme faux crit\u00e8res d’\u00e9valuation, les douleurs thoraciques qui \u00e9tait associ\u00e9es \u00e0 la prise d’IPP comme les infections urinaires et les douleurs articulaires. L’association existe mais elle n’a probablement aucun lien de causalit\u00e9. Les IPP n’augmentent probablement pas le risque de faire une pneumopathie.<\/p>\n

      \n
    1. Jena, Anupam B, Eric Sun, et Dana P Goldman. \u00ab\u00a0Confounding in the Association of Proton Pump Inhibitor Use With Risk of Community-Acquired Pneumonia\u00a0\u00bb. Journal of general internal medicine<\/i> (septembre 7, 2012). doi:10.1007\/s11606-012-2211-5<\/li>\n<\/ol>\n

      Je trouve l’approche tr\u00e8s int\u00e9ressante, elle ne r\u00e9sout pas tous les probl\u00e8mes, mais bien utilis\u00e9e, avec mesure, elle doit am\u00e9liorer la qualit\u00e9 des r\u00e9sultats. Elle devrait\u00a0 \u00eatre utilis\u00e9 de fa\u00e7on syst\u00e9matique dans toutes les \u00e9tudes d’associations accompagnant la production massive de donn\u00e9es promise par les data scientists<\/a>. Nous verrons si cette approche originale sera utilis\u00e9e.<\/p>\n

      Il faut faire tr\u00e8s attention avec les associations avant de conclure, m\u00eame si elles font de tr\u00e8s bon tweets, messages simples et percutants: \u00ab\u00a0la viande rouge tue\u00a0\u00bb, \u00ab\u00a0manger du riz augmente le risque de diab\u00e8te\u00a0\u00bb, etc. Je c\u00e8de souvent \u00e0 cette facilit\u00e9, je le confesse. Il n’y a pas que moi car elles fournissent l’essentiel des br\u00e8ves sant\u00e9 de presse permettant d’augmenter facilement le passage sur des sites d’information en ligne.<\/p>\n

      Si vous voulez aller plus loin sur le sujet, je vous conseille l’excellent \u00ab\u00a0Between the Lines\u00a0\u00bb<\/a> de Marya Zilberberg et son blog<\/a>, sans oublier la boite \u00e0 outils de Healthnewsreview<\/a>.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

      J’ai pris pas mal de retard dans ma veille bibliographique, j’en suis r\u00e9duit \u00e0 lire le JAMA de mercredi dernier, aujourd’hui. J’y ai d\u00e9couvert un point de vue tr\u00e8s int\u00e9ressant. Prasad V, Jena AB. \u00ab\u00a0Prespecified falsification end points: Can they … Continuer la lecture →<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"jetpack_post_was_ever_published":false,"_jetpack_newsletter_access":"","_jetpack_dont_email_post_to_subs":false,"_jetpack_newsletter_tier_id":0,"_jetpack_memberships_contains_paywalled_content":false,"_jetpack_memberships_contains_paid_content":false,"footnotes":"","jetpack_publicize_message":"","jetpack_publicize_feature_enabled":true,"jetpack_social_post_already_shared":true,"jetpack_social_options":{"image_generator_settings":{"template":"highway","default_image_id":0,"font":"","enabled":false},"version":2}},"categories":[13,61],"tags":[581,580,582,583],"class_list":["post-1390","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-medecine-2","category-science","tag-association","tag-data","tag-falsification","tag-statistique"],"jetpack_publicize_connections":[],"jetpack_featured_media_url":"","jetpack_shortlink":"https:\/\/wp.me\/p1l1zM-mq","jetpack_sharing_enabled":true,"jetpack-related-posts":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1390","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1390"}],"version-history":[{"count":7,"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1390\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1397,"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1390\/revisions\/1397"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1390"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=1390"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=1390"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}