{"id":159,"date":"2011-02-20T11:03:46","date_gmt":"2011-02-20T10:03:46","guid":{"rendered":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/?p=159"},"modified":"2011-02-20T11:03:46","modified_gmt":"2011-02-20T10:03:46","slug":"un-article-qui-pose-quelques-questions","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/2011\/02\/20\/un-article-qui-pose-quelques-questions\/","title":{"rendered":"Un article qui pose quelques questions."},"content":{"rendered":"<p><a href=\"http:\/\/jasn.asnjournals.org\/\">JASN<\/a> est le journal num\u00e9ro 1 dans la sp\u00e9cialit\u00e9, m\u00eame si son IF n&rsquo;est pas forcement tr\u00e8s \u00e9lev\u00e9 (7,8). En tant que journal leader, il a des responsabilit\u00e9s dans la qualit\u00e9 des \u00e9tudes publi\u00e9es. La majorit\u00e9 des articles sont de tr\u00e8s bonnes qualit\u00e9s voir excellents. Parfois, ce n&rsquo;est pas le cas et c&rsquo;est d&rsquo;autant plus choquant.<\/p>\n<p>Un article vient de sortir dans JASN express.<\/p>\n<ol>\n<li>Adriana M. Hung et al., \u201cIL-1\u03b2 Receptor Antagonist Reduces Inflammation in Hemodialysis Patients,\u201d <span style=\"font-style: italic;\">Journal of the American Society of Nephrology<\/span> (sans date), <a href=\"http:\/\/jasn.asnjournals.org\/content\/early\/2011\/02\/18\/ASN.2010070760.abstract\">http:\/\/jasn.asnjournals.org\/content\/early\/2011\/02\/18\/ASN.2010070760.abstract<\/a>.\u00a0\u00a0<span class=\"Z3988\" title=\"url_ver=Z39.88-2004&amp;ctx_ver=Z39.88-2004&amp;rft_id=info%3Adoi\/10.1681\/ASN.2010070760&amp;rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&amp;rft.genre=article&amp;rft.atitle=IL-1%CE%B2%20Receptor%20Antagonist%20Reduces%20Inflammation%20in%20Hemodialysis%20Patients&amp;rft.jtitle=Journal%20of%20the%20American%20Society%20of%20Nephrology&amp;rft.aufirst=Adriana%20M.&amp;rft.aulast=Hung&amp;rft.au=Adriana%20M.%20Hung&amp;rft.au=Charles%20D.%20Ellis&amp;rft.au=Ayumi%20Shintani&amp;rft.au=Cindy%20Booker&amp;rft.au=T.%20Alp%20Ikizler\"> <\/span><\/li>\n<\/ol>\n<p>Je n&rsquo;ose pas en conseiller la lecture. En fait, oui, il faut le lire, c&rsquo;est un bel exercice.<\/p>\n<p>Je suis un gar\u00e7on b\u00eate et disciplin\u00e9.<\/p>\n<p><a href=\"http:\/\/kystes.blog.lemonde.fr\/2009\/03\/07\/dix-questions-clefs-a-se-poser-en-lisant-un-article-medical\/\">En LCA<\/a>, la premi\u00e8re question a se poser est: Est ce que la question pos\u00e9e par l&rsquo;\u00e9tude est relevante?<\/p>\n<p>Le but est de montrer qu&rsquo;un antagoniste du recepteur de l&rsquo;Il-1 recombinant (Il1-ra) va diminuer la CRP chez des h\u00e9modialys\u00e9s chroniques.<\/p>\n<p>Est il utile de faire diminuer la CRP, pour par exemple diminuer la mortalit\u00e9 d&rsquo;origine cardio-vasculaire? Voil\u00e0 une bonne question, la r\u00e9ponse est non si on croit les multiples \u00e9tudes concordantes de randomisation mend\u00e9lienne.<\/p>\n<ol>\n<li>C Reactive Protein Coronary Heart Disease Genetics Collaboration (CCGC), \u201cAssociation between C reactive protein and coronary heart disease: mendelian randomisation analysis based on individual participant data,\u201d <span style=\"font-style: italic;\">BMJ<\/span> 342, n\u00b0. 15 (2, 2011): d548-d548.\u00a0 <span class=\"Z3988\" title=\"url_ver=Z39.88-2004&amp;ctx_ver=Z39.88-2004&amp;rft_id=info%3Adoi\/10.1136\/bmj.d548&amp;rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&amp;rft.genre=article&amp;rft.atitle=Association%20between%20C%20reactive%20protein%20and%20coronary%20heart%20disease%3A%20mendelian%20randomisation%20analysis%20based%20on%20individual%20participant%20data&amp;rft.jtitle=BMJ&amp;rft.stitle=BMJ&amp;rft.volume=342&amp;rft.issue=feb15%202&amp;rft.aulast=C%20Reactive%20Protein%20Coronary%20Heart%20Disease%20Genetics%20Collaboration%20(CCGC)&amp;rft.au=C%20Reactive%20Protein%20Coronary%20Heart%20Disease%20Genetics%20Collaboration%20(CCGC)&amp;rft.date=2011&amp;rft.pages=d548-d548&amp;rft.issn=0959-8138\"><br \/>\n<\/span><\/li>\n<\/ol>\n<p>Aucune n&rsquo;est en faveur d&rsquo;un r\u00f4le initiateur de la CRP dans la gen\u00e8se de la maladie ath\u00e9romateuse. La CRP n&rsquo;est qu&rsquo;un marqueur passif dans l&rsquo;histoire.<\/p>\n<ol>\n<li>B. Keavney, \u201cC reactive protein and the risk of cardiovascular disease,\u201d <span style=\"font-style: italic;\">BMJ<\/span> 342, n\u00b0. 15 (2, 2011): d144-d144.\u00a0 <span class=\"Z3988\" title=\"url_ver=Z39.88-2004&amp;ctx_ver=Z39.88-2004&amp;rft_id=info%3Adoi\/10.1136\/bmj.d144&amp;rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&amp;rft.genre=article&amp;rft.atitle=C%20reactive%20protein%20and%20the%20risk%20of%20cardiovascular%20disease&amp;rft.jtitle=BMJ&amp;rft.stitle=BMJ&amp;rft.volume=342&amp;rft.issue=feb15%202&amp;rft.aufirst=B.&amp;rft.aulast=Keavney&amp;rft.au=B.%20Keavney&amp;rft.date=2011&amp;rft.pages=d144-d144&amp;rft.issn=0959-8138\"><br \/>\n<\/span><\/li>\n<\/ol>\n<p>Il n&rsquo;y a pas de raison de penser que diminuer la CRP soit utile. Le crit\u00e8re principal annonc\u00e9 de l&rsquo;\u00e9tude est ainsi sans int\u00e9r\u00eat. Il en aurait diff\u00e9remment si le but des auteurs eut \u00e9t\u00e9 de diminuer le syndrome inflammatoire des patients. L&rsquo;id\u00e9e dominante, actuellement, est que l&rsquo;inflammation n&rsquo;entraine pas de maladie ath\u00e9romateuse par elle m\u00eame, mais qu&rsquo;elle est un facteur pr\u00e9cipitant et acc\u00e9l\u00e9rateur chez des patients \u00e0 risque cardio-vasculaire (cf une tr\u00e8s bonne session sur le sujet \u00e0 l&rsquo;ERA-EDTA 2010). J&rsquo;aurai pu m&rsquo;arr\u00eater de lire et ne pas perdre mon temps. Je suis masochiste.<\/p>\n<p>En LCA, on conseille de lire les m\u00e9thodes pour s&rsquo;assurer que les r\u00e9sultats fournis seront de qualit\u00e9.<\/p>\n<p>C&rsquo;est un essai randomis\u00e9 en double aveugle utilisant<a href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Anakinra\"> l&rsquo;Anakinra<\/a> contre un placebo en sous cutan\u00e9 pendant quatre semaines. Il y a un calcul d&rsquo;effectif qui pr\u00e9voyait d&rsquo;inclure 30 patients seulement 22 seront randomis\u00e9s et 14, 7 dans chaque bras, finiront l&rsquo;\u00e9tude. C&rsquo;est un probl\u00e8me. Ils s&rsquo;en sortent, bien \u00e9videment, en annon\u00e7ant qu&rsquo;une analyse interm\u00e9diaire \u00e9tait pr\u00e9vue et que le comit\u00e9 de surveillance a donn\u00e9 son accord pour l&rsquo;arr\u00eat de l&rsquo;\u00e9tude. On peut se demander qui a pu dire qu&rsquo;il fallait une analyse interm\u00e9diaire quand on pr\u00e9voit d&rsquo;inclure 30 patients avec des crit\u00e8res d&rsquo;inclusion finalement peu restrictifs. Il y a un gros biais, le nombre de patients \u00e0 inclure n&rsquo;est pas atteints.<\/p>\n<p>On va finir avec l&rsquo;inclusion, il leur a fallu plus de deux ans et demi pour 22 patients (4 perdus en cours de route sur 4 semaines de traitement au total). Les auteurs auront screen\u00e9 239 patients, ils n&rsquo;en ont pas inclus\u00a0 10%. La population s\u00e9lectionn\u00e9e n&rsquo;est probablement pas un bon reflet de la population g\u00e9n\u00e9rale des dialys\u00e9s. Encore une limite au travail. Enfin, sur 11 patients inclus dans chaque bras, en perdre un tiers sur une p\u00e9riode de 4 semaines, n&rsquo;est pas loin d&rsquo;une performance unique.<\/p>\n<p>Je suis ensuite aller regarder, sur Clinicaltrials (NCT00420290) <a href=\"http:\/\/clinicaltrials.gov\/ct2\/show\/NCT00420290\">le synopsis de l&rsquo;\u00e9tude<\/a>. Et l\u00e0, oh surprise, chose extraordinaire, sublime, les crit\u00e8res principaux et secondaires d\u00e9clar\u00e9s dans le papier et sur Clinicaltrials sont diff\u00e9rents. Les \u00e9tudes ancillaires tous le monde en fait, ce n&rsquo;est pas un reproche, mais au moins on cite dans le papier que ce n&rsquo;est pas le sujet principal du travail. Ici, la situation est totalement diff\u00e9rente.<\/p>\n<p>Sur Clinicaltrials:<\/p>\n<blockquote><p>Primary Outcome Measures:<\/p>\n<ul>\n<li>A decrease in muscle protein breakdown [\u00a0Time\u00a0Frame:\u00a01 month\u00a0] [\u00a0Designated\u00a0as\u00a0safety\u00a0issue:\u00a0No\u00a0]<\/li>\n<\/ul>\n<\/blockquote>\n<blockquote><p>Secondary Outcome Measures:<\/p><\/blockquote>\n<ul>\n<blockquote>\n<li>A change in C-reactive protein (CRP) and serum amyloid A levels [\u00a0Time\u00a0Frame:\u00a01 month\u00a0] [\u00a0Designated\u00a0as\u00a0safety\u00a0issue:\u00a0No\u00a0]<\/li>\n<\/blockquote>\n<blockquote>\n<li>whole-body protein turnover rate [\u00a0Time\u00a0Frame:\u00a01 month\u00a0] [\u00a0Designated\u00a0as\u00a0safety\u00a0issue:\u00a0No\u00a0]<\/li>\n<\/blockquote>\n<\/ul>\n<p>Dans le papier:<\/p>\n<blockquote><p>The primary endpoint was the percent change in serum hsCRP from baseline to 4 weeks. Secondary outcomes were the percent changes in IL-6, serum prealbumin, serum albumin, and LBM from baseline to 4 weeks.<\/p><\/blockquote>\n<p>J&rsquo;ai fait copier coller pour \u00e9viter toute accusation de mauvaise interpr\u00e9tation.<\/p>\n<p>Je finis avec mes ctrl-C ou V<\/p>\n<p>Sur Clinicaltrials<\/p>\n<blockquote><p>Study Start Date: July 2007<\/p><\/blockquote>\n<blockquote><p>Study Completion Date: June 2010<\/p><\/blockquote>\n<p>Dans le papier:<\/p>\n<blockquote><p>This study was conducted at the Vanderbilt University Medical Center and Nashville Veterans Affairs Outpatient Dialysis units between January 2008 and May 2010.<\/p><\/blockquote>\n<p>Comme vous pouvez le constater, il y a des diff\u00e9rences assez importantes entre les objectifs annonc\u00e9s au d\u00e9p\u00f4t du projet et dans les r\u00e9sultats. J&rsquo;ai du mal \u00e0 imaginer que le calcul d&rsquo;effectif n&rsquo;a pas \u00e9t\u00e9 r\u00e9alis\u00e9 pour l&rsquo;objectif primaire d\u00e9pos\u00e9 dans Clinicaltrials. Il est rare de faire un calcul d&rsquo;effectif sur un crit\u00e8re secondaire comme ils l&rsquo;annoncent dans leur article. Je ne suis pas un grand m\u00e9thodologiste, mais je trouve \u00e7a bizarre.<\/p>\n<p>Il transforme un crit\u00e8re secondaire en crit\u00e8re principal, ce qui est assez fort. Personne ne voit rien ou n&rsquo;est all\u00e9 v\u00e9rifi\u00e9. Je trouve \u00e7a extraordinaire et montre bien les qualit\u00e9s limites du peer reviewing et du travail de l&rsquo;\u00e9diteur. \u00c7a ne prend pas beaucoup de temps d&rsquo;aller jeter un coup d&rsquo;\u0153il sur internet, surtout quand c&rsquo;est son m\u00e9tier.<\/p>\n<p>Montrer une diminution de la destruction des prot\u00e9ines musculaire ou une diminution de la CRP par une intervention th\u00e9rapeutique, ce n&rsquo;est pas exactement la m\u00eame chose. Je passe sur le fait que dans le crit\u00e8re secondaire annonc\u00e9 on parle de la SAA. Elle disparait dans le papier pour laisser la place \u00e0 l&rsquo;Il-6. Un dosage \u00e0 mon sens inutile. L&rsquo;Il-6 est la cytokine majeure augmentant la production h\u00e9patique de CRP. Deux fa\u00e7ons de dire la m\u00eame chose en tentant de faire du scientifique.<\/p>\n<p>Je ne vois vraiment pas l&rsquo;int\u00e9r\u00eat de d\u00e9poser des \u00e9tudes dans des d\u00e9p\u00f4ts si personne n&rsquo;utilise ces infos pour v\u00e9rifier les dires des auteurs.<\/p>\n<p>Cet article est un beau sympt\u00f4me du malaise dans la recherche bio-m\u00e9dicale et l&rsquo;industrie de l&rsquo;\u00e9dition. <a href=\"http:\/\/retractionwatch.wordpress.com\/\">Retraction watch<\/a> et <a href=\"http:\/\/embargowatch.wordpress.com\/\">Embargo watch<\/a> fournissent tous les jours d&rsquo;autres signes.<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone\" title=\"freud wharol\" src=\"http:\/\/www.artknowledgenews.com\/files2008\/AndyWarholSigmundFreud.jpg\" alt=\"\" width=\"600\" height=\"670\" \/><\/p>\n<p>Je ne m&rsquo;\u00e9tendrai pas sur les r\u00e9sultats de l&rsquo;article, qui montre que la CRP baisse quand on injecte trois fois par semaine un Il-1ra fourni par la soci\u00e9t\u00e9 Amgen \u00e0 des h\u00e9modialys\u00e9s. Une grande d\u00e9couverte qui va bouleverser la prise en charge des insuffisants r\u00e9naux chroniques (point d&rsquo;ironie).<\/p>\n<p>Je ne dirai pas que les groupes n&rsquo;\u00e9taient pas identiques, plus de diab\u00e9tiques dans le groupe placebo (une vraie performance avec 7 patients), que la CRP m\u00e9diane est deux fois plus importante que dans le placebo que dans les sujets trait\u00e9s (diff\u00e9rence non significative, 7 patients contre 7). L&rsquo;analyse a \u00e9t\u00e9 faite en per protocol (on le dit pas) et non en intention de traiter, \u00e9liminant quatre patients dans chaque groupe. Ceci eut \u00e9t\u00e9 important d&rsquo;avoir les donn\u00e9es en particulier dans le groupe traitement car 2 patients arr\u00eatent \u00e0 cause d&rsquo;un effet secondaire direct du m\u00e9dicament (douleur \u00e0 l&rsquo;injection), un patient du fait d&rsquo;une possible complication du traitement (infection du site d&rsquo;acc\u00e8s). C&rsquo;est pas mal quand sur 11 patients, 3 arr\u00eatent du fait d&rsquo;effets secondaires. Il \u00e9tait d&rsquo;autant plus justifi\u00e9 de faire une analyse en intention de traiter.<\/p>\n<p>Pour ceux que cela int\u00e9resse, une \u00e9tude Cochrane vient d&rsquo;\u00eatre publi\u00e9e qui tente d&rsquo;\u00e9valuer les risques des bioth\u00e9rapies (il y a plus d&rsquo;effets secondaires).<\/p>\n<ol>\n<li>Jasvinder A Singh et al., \u201cAdverse effects of biologics: a network meta-analysis and Cochrane overview,\u201d <span style=\"font-style: italic;\">Cochrane Database of Systematic Reviews (Online)<\/span> 2 (2011): CD008794.\u00a0\u00a0<span class=\"Z3988\" title=\"url_ver=Z39.88-2004&amp;ctx_ver=Z39.88-2004&amp;rft_id=info%3Adoi\/10.1002\/14651858.CD008794.pub2&amp;rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&amp;rft.genre=article&amp;rft.atitle=Adverse%20effects%20of%20biologics%3A%20a%20network%20meta-analysis%20and%20Cochrane%20overview&amp;rft.jtitle=Cochrane%20Database%20of%20Systematic%20Reviews%20(Online)&amp;rft.stitle=Cochrane%20Database%20Syst%20Rev&amp;rft.volume=2&amp;rft.aufirst=Jasvinder%20A&amp;rft.aulast=Singh&amp;rft.au=Jasvinder%20A%20Singh&amp;rft.au=George%20A%20Wells&amp;rft.au=Robin%20Christensen&amp;rft.au=Elizabeth%20Tanjong%20Ghogomu&amp;rft.au=Lara%20Maxwell&amp;rft.au=John%20K%20Macdonald&amp;rft.au=Graziella%20Filippini&amp;rft.au=Nicole%20Skoetz&amp;rft.au=Damian%20Francis&amp;rft.au=Luciane%20C%20Lopes&amp;rft.au=Gordon%20H%20Guyatt&amp;rft.au=Jochen%20Schmitt&amp;rft.au=Loredana%20La%20Mantia&amp;rft.au=Tobias%20Weberschock&amp;rft.au=Juliana%20F%20Roos&amp;rft.au=Hendrik%20Siebert&amp;rft.au=Sarah%20Hershan&amp;rft.au=Michael%20Pt%20Lunn&amp;rft.au=Peter%20Tugwell&amp;rft.au=Rachelle%20Buchbinder&amp;rft.date=2011&amp;rft.pages=CD008794&amp;rft.issn=1469-493X\"> <\/span><\/li>\n<\/ol>\n<p>Pour la pratique, il n&rsquo;y a aucune raison d&rsquo;injecter un Il1-ra recombinant chez un h\u00e9modialys\u00e9 chronique et surtout pas ce papier. J&rsquo;esp\u00e8re vous avoir montrer que la LCA pr\u00e9sente un int\u00e9r\u00eat. Je suis choqu\u00e9 qu&rsquo;un tel papier ait pu passer dans un bon journal. Je ne vois pas comment l&rsquo;\u00e9diteur de JASN pourra refuser un article pour des questions de m\u00e9thodologie apr\u00e8s cette petite merveille.<\/p>\n<p>Une petite anecdote, l&rsquo;\u00e9diteur du petit fr\u00e8re de JASN, cJASN, n&rsquo;a pas envoy\u00e9 un article soumis aux reviewers. J&rsquo;ai demand\u00e9 pourquoi, d&rsquo;autant que dans le mail, il parlait de \u00ab\u00a0methodologic concerns\u00a0\u00bb. C&rsquo;est toujours inqui\u00e9tant. La r\u00e9ponse, votre \u00e9tude est monocentrique, c&rsquo;est le principal probl\u00e8me. Dommage que cet article ne soit pas sorti avant.<\/p>\n<p>J&rsquo;aimerai avoir l&rsquo;opinion des sp\u00e9cialistes en m\u00e9thodologie (<a href=\"http:\/\/grangeblanche.com\/\">Jean-Marie<\/a> comme tu suis des enseignements dans le domaine) sur les points qui me choquent. Juste pour savoir si j&rsquo;ai enfin compris quelque chose dans ce domaine.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>JASN est le journal num\u00e9ro 1 dans la sp\u00e9cialit\u00e9, m\u00eame si son IF n&rsquo;est pas forcement tr\u00e8s \u00e9lev\u00e9 (7,8). En tant que journal leader, il a des responsabilit\u00e9s dans la qualit\u00e9 des \u00e9tudes publi\u00e9es. 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