{"id":1800,"date":"2013-12-23T17:33:45","date_gmt":"2013-12-23T16:33:45","guid":{"rendered":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/?p=1800"},"modified":"2013-12-23T17:33:45","modified_gmt":"2013-12-23T16:33:45","slug":"epissage-et-insuffisance-renale-chronique","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/2013\/12\/23\/epissage-et-insuffisance-renale-chronique\/","title":{"rendered":"Epissage et insuffisance r\u00e9nale chronique"},"content":{"rendered":"<p>L&rsquo;insuffisance r\u00e9nale chronique se caract\u00e9rise pas l&rsquo;accumulation de toxines ur\u00e9miques qui sont normalement \u00e9pur\u00e9es par le rein. Les m\u00e9canismes mol\u00e9culaires conduisant ces petites mol\u00e9cules aux complications sont mal connus. Certaines toxines modulent l&rsquo;activation d&rsquo;un <a href=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/?p=1506\">facteur de transcription comme AHR<\/a> modifiant ainsi l&rsquo;expression des g\u00e8nes au niveau transcriptionnel, l&rsquo;<a href=\"http:\/\/www.thelancet.com\/journals\/lancet\/article\/PIIS0140-6736%2803%2913372-7\/abstract\">homocyst\u00e9ine modifie la m\u00e9thylation<\/a> des g\u00e8nes et ainsi joue sur la transcription. Il existe finalement peu de donn\u00e9es expliquant comment l&rsquo;ur\u00e9mie modulent l&rsquo;expression g\u00e9nique en dehors d&rsquo;un contr\u00f4le transcriptionnel.<\/p>\n<p>Un niveau important de la r\u00e9gulation post-transcriptionnelle est la modulation du <a href=\"http:\/\/fr.wikipedia.org\/wiki\/%C3%89pissage\">ph\u00e9nom\u00e8ne d&rsquo;\u00e9pissage<\/a>. Comme vous le savez, les g\u00e8nes sont compos\u00e9s <a href=\"http:\/\/www.eurasnet.info\/education\/alternate-splicing\/what-is-alternate-splicing\">d&rsquo;introns et d&rsquo;exons<\/a>. Les exons codent l&rsquo;information qui permettra la production d&rsquo;une prot\u00e9ine. Les introns, s&rsquo;ils sont transcrits, ne seront pas traduits. L&rsquo;ARN messager doit \u00ab\u00a0murir\u00a0\u00bb. Les introns sont enlev\u00e9s pour mettre bout \u00e0 bout les exons et produire une information facilement traduisible. Les cellules sont capables d&rsquo;\u00e9pisser alternativement les ARNm pr\u00e9messager. Ceci augmente de fa\u00e7on tr\u00e8s importante la complexit\u00e9 de l&rsquo;information cod\u00e9e par un nombre limit\u00e9 de g\u00e8nes. Il est estim\u00e9 qu&rsquo;en moyenne il existe trois \u00e0 quatre formes \u00e9piss\u00e9es alternativement par g\u00e8ne. <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/14684825\">75% des g\u00e8nes humains<\/a> sont \u00e9piss\u00e9s. La cellule multiplie ainsi par trois sa capacit\u00e9 informationnelle de fa\u00e7on assez simple.<\/p>\n<p><iframe loading=\"lazy\" src=\"\/\/www.youtube.com\/embed\/FVuAwBGw_pQ\" height=\"315\" width=\"420\" allowfullscreen=\"\" frameborder=\"0\"><\/iframe><\/p>\n<p>L&rsquo;\u00e9pissage est rencontr\u00e9 en pathologie essentiellement dans les maladies g\u00e9n\u00e9tiques. Des mutations des sites consensus d&rsquo;\u00e9pissage peuvent entrainer des anomalies d&rsquo;\u00e9pissages qui vont conduire \u00e0 la production d&rsquo;un ARNm qui ne codera plus la bonne information et pourra ainsi \u00eatre responsable, essentiellement par d\u00e9faut de production de la prot\u00e9ine, d&rsquo;une maladie g\u00e9n\u00e9tique.<\/p>\n<p>En dehors des maladies g\u00e9n\u00e9tiques, c&rsquo;est essentiellement dans le domaine du cancer que des anomalies de l&rsquo;\u00e9pissage ont \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9es. Ceci \u00e0 pu conduire <a href=\"http:\/\/www.exonhit.com\/fr\/diagnostic\/portefeuille\">certaines soci\u00e9t\u00e9s<\/a> \u00e0 proposer cette approche comme aide au diagnostic et \u00e0 la prise en charge. En dehors du cancer et de la r\u00e9ponse \u00e0 des m\u00e9dicaments, <a href=\"http:\/\/www.eurasnet.info\/\">les modifications du transcriptome induites par une perturbation de la machinerie d&rsquo;\u00e9pissages<\/a> a \u00e9t\u00e9 peu ou pas \u00e9tudi\u00e9es en pathologie.<\/p>\n<p>Un article, <a href=\"http:\/\/www.plosone.org\/article\/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0082702\">publi\u00e9 r\u00e9cemment<\/a>, analyse un possible r\u00f4le des anomalies d&rsquo;\u00e9pissage dans l&rsquo;insuffisance r\u00e9nale chronique.<\/p>\n<blockquote><p>Sall\u00e9e, Marion, Michel Font\u00e8s, Laurence Louis, Claire C\u00e9rini, Philippe Brunet, et St\u00e9phane Burtey. \u00ab\u00a0Alternative Splicing Events Is Not a Key Event for Gene Expression Regulation in Uremia\u00a0\u00bb. <i>PLoS ONE<\/i> 8, n<sup>o<\/sup> 12 (16 d\u00e9cembre 2013): e82702. doi:10.1371\/journal.pone.0082702.<\/p><\/blockquote>\n<p>Il s&rsquo;agit du premier article s&rsquo;int\u00e9ressant \u00e0 ce probl\u00e8me. Les auteurs ont identifi\u00e9 un \u00e9pissage alternatif de <a href=\"http:\/\/ghr.nlm.nih.gov\/gene\/PKD1\"><em>PKD1<\/em> <\/a>dans les leucocytes de patients insuffisants r\u00e9naux chroniques. Cette d\u00e9couverte est du au hasard. Lors de la mise au point d&rsquo;une <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pmc\/articles\/PMC1735136\/\">nouvelle strat\u00e9gie, par RT-PCR<\/a>, pour identifier des mutations de ce g\u00e8ne responsable de la polykystose r\u00e9nale autosomique dominante, un des auteurs a constat\u00e9 que l&rsquo;exon 30 \u00e9tait absent chez les patients h\u00e9modialys\u00e9s mais pr\u00e9sent chez les membres d&rsquo;une m\u00eame famille sans insuffisance r\u00e9nale mais porteurs de la maladie. Cette anomalie de l&rsquo;\u00e9pissage n&rsquo;\u00e9tait pas responsable de la PKD.<\/p>\n<p>Pour confirm\u00e9 ce ph\u00e9nom\u00e8ne, les auteurs ont recherch\u00e9 la pr\u00e9sence de l&rsquo;\u00e9pissage dans un groupe de patients h\u00e9modialys\u00e9s chroniques, o\u00f9 il est pr\u00e9sent dans 100% des cas, de patients avec une insuffisance r\u00e9nale chronique, il est pr\u00e9sent dans 75% des cas et enfin dans un groupe contr\u00f4le, l&rsquo;\u00e9pissage est pr\u00e9sent dans 30% des cas. Cet \u00e9pissage est significativement plus fr\u00e9quemment rencontr\u00e9 chez les patients insuffisants r\u00e9naux chroniques que chez les contr\u00f4les.<\/p>\n<p>Les auteurs ont d\u00e9cid\u00e9 de r\u00e9aliser une \u00e9tude in vitro \u00e0 la recherche de nouveau \u00e9pissage. La technique choisie a \u00e9t\u00e9 <a href=\"http:\/\/www.genomics.agilent.com\/en\/product.jsp?cid=cat160012&amp;tabId=AG-PR-1077&amp;_requestid=2565238\">celle des puces exoniques<\/a>, il s&rsquo;agit de microarrays d&rsquo;expression sur lesquelles l&rsquo;ensemble des exons est pr\u00e9sent. Gr\u00e2ce \u00e0 un traitement bio-informatique, il est possible de d\u00e9finir entre deux conditions si il existe des \u00e9pissages alternatifs pr\u00e9sents. Les auteurs ont compar\u00e9 des fibroblastes expos\u00e9 \u00e0 un pool de s\u00e9rum ur\u00e9mique (fonds de tube de 30 h\u00e9modialys\u00e9s chroniques) \u00e0 des cellules expos\u00e9es \u00e0 un s\u00e9rum contr\u00f4le indemne d&rsquo;insuffisance r\u00e9nale chronique. Apr\u00e8s trois jours de culture, les ARN sont extraits et hybrid\u00e9s sur les puces. Les r\u00e9sultats sont d\u00e9cevants car un seul \u00e9pissage alternatif a pu \u00eatre identifi\u00e9. Le g\u00e8ne diff\u00e9rentiellement \u00e9piss\u00e9 est <em>ADH1B<\/em>.<\/p>\n<p>Si l&rsquo;insuffisance r\u00e9nale chronique peut \u00eatre associ\u00e9e \u00e0 l&rsquo;apparition d&rsquo;\u00e9pissage alternatif de certains g\u00e8nes, ce n&rsquo;est pas un ph\u00e9nom\u00e8ne fr\u00e9quent. Il est probable que cette voie de r\u00e9gulation de l\u2019expression g\u00e9nique joue un r\u00f4le limit\u00e9.<\/p>\n<p>La publication de r\u00e9sultats n\u00e9gatifs reste rare et difficile. Elle est n\u00e9anmoins importante car elle peut \u00e9viter \u00e0 d&rsquo;autres groupes de se lancer dans des exp\u00e9riences futiles. Les exp\u00e9riences n\u00e9gatives font aussi avancer la connaissance.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>L&rsquo;insuffisance r\u00e9nale chronique se caract\u00e9rise pas l&rsquo;accumulation de toxines ur\u00e9miques qui sont normalement \u00e9pur\u00e9es par le rein. 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