{"id":2663,"date":"2014-08-29T12:05:45","date_gmt":"2014-08-29T11:05:45","guid":{"rendered":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/?p=2663"},"modified":"2014-08-29T12:05:45","modified_gmt":"2014-08-29T11:05:45","slug":"quand-big-data-est-futile","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/2014\/08\/29\/quand-big-data-est-futile\/","title":{"rendered":"Quand big data est futile"},"content":{"rendered":"<p>La donn\u00e9e est devenue le nouvel eldorado des chercheurs de p\u00e9pites. L&rsquo;utilisation des Big Data est en passe de devenir le graal du savoir m\u00e9dical. La r\u00e9cup\u00e9ration de grands jeux de donn\u00e9es et leur moulinage dans des logiciels de statistiques doivent, si on en croit nos proph\u00e8tes digitaux, r\u00e9soudre tout les probl\u00e8mes et combler toutes les failles de la connaissance. Le sp\u00e9cialiste, quand on veut lui faire l\u00e0 peau on l&rsquo;appelle \u00ab\u00a0expert\u00a0\u00bb, n&rsquo;a qu&rsquo;\u00e0 bien se tenir. Sa parole n&rsquo;aura aucun point face \u00e0 l&rsquo;avalanche de donn\u00e9es. Au mieux, il servira \u00e0 produire ces chiffres, au pire, c&rsquo;est un emmerdeur r\u00e9actionnaire qui s&rsquo;oppose \u00e0 l&rsquo;avanc\u00e9e de la science et du business.<\/p>\n<p>Je crois \u00e0 l&rsquo;utilisation de ces monceaux de donn\u00e9es, je suis convaincu de l&rsquo;int\u00e9r\u00eat de big data. Je pense juste qu&rsquo;il faut parfois analyser les r\u00e9sultats \u00e0 la lumi\u00e8re d&rsquo;un truc qui parait un peu obsol\u00e8te, mais qui est finalement important, qui s&rsquo;appelle l&rsquo;exp\u00e9rience clinique de terrain.<\/p>\n<p>Un <a href=\"https:\/\/twitter.com\/totomathon\">blogueur\/twitoss<\/a> m&rsquo;a signal\u00e9 ce tweet. Je le remercie chaleureusement.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2014\/08\/tweet-HD.jpg\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-full wp-image-2664\" src=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2014\/08\/tweet-HD.jpg\" alt=\"tweet HD\" width=\"635\" height=\"326\" srcset=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2014\/08\/tweet-HD.jpg 635w, https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2014\/08\/tweet-HD-300x154.jpg 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 635px) 100vw, 635px\" \/><\/a>Inqui\u00e9tant, l&rsquo;h\u00e9modialyse en urgence double le risque de mortalit\u00e9, j&rsquo;adore le Oops. Oh, la m\u00e9chante technique qui tue les gens. Je suis aller jet\u00e9 un coup d\u2019\u0153il sur l&rsquo;article, ce qu&rsquo;on devrait toujours faire avant de tweeter avec un Oops.<\/p>\n<p>Le titre original est \u00ab\u00a0Survival after Acute Hemodialysis in Pennsylvania, 2005\u20132007: A Retrospective Cohort Study\u00a0\u00bb publi\u00e9 dans <a href=\"http:\/\/www.plosone.org\/article\/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0105083\">Plos One en Aout 2014<\/a>. Bri\u00e8vement, les auteurs ont utilis\u00e9 un jeu de donn\u00e9es reposant sur plus de deux millions d&rsquo;admission entre 2005 et 2007. Ils ont identifi\u00e9 6657 cas n\u00e9cessitant de l&rsquo;h\u00e9modialyse en urgence et ils ont compar\u00e9 la survie de ces patients \u00e0 la cohorte et quand m\u00eame dans un deuxi\u00e8me temps, ils ont ajust\u00e9 la comparaison avec un <a href=\"http:\/\/www.rees-france.com\/article.php3?id_article=399\">score de propension<\/a>. Il s&rsquo;agit d&rsquo;une \u00e9tude de registre donc les auteurs n&rsquo;ont que les donn\u00e9es pr\u00e9sentent, en particulier, il ajuste sur la donn\u00e9e insuffisance r\u00e9nale aigue \u00e0 l&rsquo;entr\u00e9, oui\/non, sans tenir compte de la s\u00e9v\u00e9rit\u00e9 de cette derni\u00e8re. Les autres variables d&rsquo;ajustement sont dans la l\u00e9gende de la figure 3.<\/p>\n<p>Tout le message de l&rsquo;article tient dans cette figure 3.<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone\" src=\"http:\/\/www.plosone.org\/article\/fetchObject.action?uri=info:doi\/10.1371\/journal.pone.0105083.g003&amp;representation=PNG_M\" alt=\"\" width=\"394\" height=\"286\" \/><\/p>\n<p>Si on a du dialyser en urgence, on a plus de chance de mourir dans l&rsquo;ann\u00e9e qui suit que si on a pas dialys\u00e9. Pour les auteurs, c&rsquo;est le r\u00e9sultat majeur. Ceci va contre le fait qu&rsquo;on pense que la dialyse sauve la vie des gens. Ce r\u00e9sultat est robuste car il est ajuste sur les comorbidit\u00e9s \u00e0 l&rsquo;entr\u00e9e. Ensuite la discussion n&rsquo;est qu&rsquo;une litanie contre la technique.<\/p>\n<p>Les auteurs manifestement n&rsquo;ont jamais eu \u00e0 faire de la dialyse en urgence. Il est rare qu&rsquo;on dialyse les gens juste pour le plaisir de mettre un cath\u00e9ter et de voir tourner le sang dans le circuit extra-corporel. Leur ajustement ne veut rien dire. On ne peut pas comparer un patient avec 150 \u00b5mol\/l de cr\u00e9atinine, o\u00f9 l&rsquo;int\u00e9r\u00eat de la dialyse est nul, \u00e0 un patient \u00e0 1000 \u00b5mol\/l de cr\u00e9atinine en \u0153d\u00e8me aigu du poumon et anurique, que la dialyse va sauver. Ce travail dit juste que le fait de dialyser est un facteur pr\u00e9dictif de mortalit\u00e9 \u00e0 un an. Il ne permet en aucun cas de dire c&rsquo;est la dialyse qui tue comme les auteurs le sous entendent durant tout l&rsquo;article et je ne parle pas de la reprise en 140 caract\u00e8res. Cet article est franchement mauvais et peut conduire \u00e0 des interpr\u00e9tations dangereuses.<\/p>\n<p>Je demande juste aux auteurs de l&rsquo;article et \u00e0 tout ceux qui le trouvent formidable de participer \u00e0 ma prochaine \u00e9tude randomis\u00e9e qui consistera \u00e0 comparer h\u00e9modialyse en urgence contre traitement conservateur en cas d&rsquo;hyperkali\u00e9mie anurique, d&rsquo;OAP anurique ou d&rsquo;une cr\u00e9atinin\u00e9mie \u00e0 1200 \u00b5mol\/l apr\u00e8s avoir \u00e9limin\u00e9 bien sur les insuffisances r\u00e9nales aigu\u00ebs fonctionnelles et obstructives. Je rappelle juste <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/12660336\">cet article de 2003<\/a>, qui montrait que de ne pas d\u00e9buter la dialyse chez des patients octog\u00e9naires \u00e9tait associ\u00e9 \u00e0 une diminution de leur esp\u00e9rance de vie (m\u00e9diane de 29 mois contre 9 mois).<\/p>\n<p>Le design de mon projet est directement inspir\u00e9 de <a href=\"http:\/\/www.bmj.com\/content\/327\/7429\/1459\">cet article<\/a>.<\/p>\n<p>Le big data c&rsquo;est bien, mais son utilisation et son interpr\u00e9tation raisonn\u00e9e, c&rsquo;est mieux. Alors avant de vous laissez impressionner par des chiffres, lisez l&rsquo;article original de fa\u00e7on critique et si vous ne connaissez pas le sujet demandez son avis \u00e0 une personne avec un peu d&rsquo;exp\u00e9rience. Parfois les reviewers font leur travail d&rsquo;une dr\u00f4le de fa\u00e7on.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>La donn\u00e9e est devenue le nouvel eldorado des chercheurs de p\u00e9pites. L&rsquo;utilisation des Big Data est en passe de devenir le graal du savoir m\u00e9dical. 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