{"id":5270,"date":"2016-11-17T20:31:23","date_gmt":"2016-11-17T19:31:23","guid":{"rendered":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/?p=5270"},"modified":"2016-11-17T20:31:23","modified_gmt":"2016-11-17T19:31:23","slug":"tout-nest-pas-ecrit-dans-nos-genes","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/2016\/11\/17\/tout-nest-pas-ecrit-dans-nos-genes\/","title":{"rendered":"Tout n&rsquo;est pas \u00e9crit dans nos g\u00e8nes"},"content":{"rendered":"<p>Cet <a href=\"http:\/\/www.nejm.org\/doi\/full\/10.1056\/NEJMoa1605086\">article<\/a> est, \u00e0 mon sens, le plus important de l&rsquo;ann\u00e9e.<\/p>\n<blockquote><p>Khera AV, Emdin CA, Drake I, et al. Genetic Risk, Adherence to a Healthy Lifestyle, and Coronary Disease. <i>New England Journal of Medicine<\/i>. 2016. doi:10.1056\/NEJMoa1605086.<\/p><\/blockquote>\n<p>Nous allons \u00eatre submerg\u00e9s par les donn\u00e9es de g\u00e9nomique. Le nombre de variants dans notre capital g\u00e9n\u00e9tique <a href=\"http:\/\/massgenomics.org\/2016\/09\/dbsnp-ridiculous-variants.html\">est incroyable<\/a>. La question est qu&rsquo;en faire? Les vendeurs du r\u00eave g\u00e9n\u00e9tique voudraient que notre g\u00e9nome soit notre nouveau destin. En fonction de l&rsquo;agencement de nos variants rares ou fr\u00e9quents nous serions engag\u00e9s sur une route dont nous ne pourrions influer le parcours. Cette vision plait pour deux raisons. La premi\u00e8re est culturelle, nous avons \u00e9t\u00e9 nourris au biberon du destin in\u00e9luctable, aussi bien chez les grecs que dans la tradition chr\u00e9tienne, s&rsquo;aggravant avec l\u2019av\u00e8nement du protestantisme. L&rsquo;op\u00e9ra s&rsquo;est nourri de ces histoires o\u00f9 tout est \u00e9crit dans les astres. La deuxi\u00e8me est notre fain\u00e9antise. L&rsquo;id\u00e9e que tout est d\u00e9j\u00e0 pr\u00e9destin\u00e9 par ce que nous a donn\u00e9 comme ADN la rencontre de deux gam\u00e8tes permet de se dire que de toute fa\u00e7on le moindre effort est inutile, juste une contrainte impos\u00e9e sans impact.<\/p>\n<p>Les auteurs de cet article ont analys\u00e9 trois grandes cohortes suivies pendant quelques d\u00e9cennies, <a href=\"http:\/\/aricnews.net\/index.php\">ARIC<\/a>, <a href=\"http:\/\/clinchem.aaccjnls.org\/content\/54\/2\/249.long\">WGHS<\/a> (uniquement des femmes) et la <a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/8429286\">MDCS<\/a>. Ces cohortes avaient l&rsquo;int\u00e9r\u00eat d&rsquo;avoir des donn\u00e9es de g\u00e9nomique accessibles et des donn\u00e9es sur le mode de vie approximativement identiques. Le but des auteurs \u00e9taient d&rsquo;\u00e9valuer l&rsquo;impact du style de vie et d&rsquo;un score g\u00e9n\u00e9tique sur le risque de faire un \u00e9v\u00e9nement coronarien.<\/p>\n<p>Les auteurs ont construit un score avec 50 polymorphismes dans 48 g\u00e8nes associ\u00e9s \u00e0 un risque de maladie coronarienne (la liste est dans les supplementary data) permettant de classer les individus (51 425) en risque coronarien faible, interm\u00e9diaire et \u00e9lev\u00e9. Les quatre facteurs de mode de vie sain sont:<\/p>\n<ol>\n<li style=\"text-align: left;\">Ne pas fumer,<\/li>\n<li style=\"text-align: left;\">Ne pas \u00eatre ob\u00e8se,<\/li>\n<li style=\"text-align: left;\">Avoir une activit\u00e9 physique r\u00e9guli\u00e8re et<\/li>\n<li style=\"text-align: left;\">Avoir une alimentation saine.<\/li>\n<\/ol>\n<p>Je mets les d\u00e9finitions utilis\u00e9es pour chaque \u00e9tude.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/healthy-style.png\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-full wp-image-5272\" src=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/healthy-style.png\" alt=\"healthy-style\" width=\"756\" height=\"713\" srcset=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/healthy-style.png 756w, https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/healthy-style-300x283.png 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 756px) 100vw, 756px\" \/><\/a>Les patients sont class\u00e9s comme ayant un mode de vie favorable si ils ont 3 ou 4 crit\u00e8res remplis, interm\u00e9diaire si ils ont 2 crit\u00e8res et d\u00e9favorable si aucun ou un seul crit\u00e8re d&rsquo;un mode de vie sain.<\/p>\n<p>A l&rsquo;inclusion, les patients ont la cinquantaine, un peu plus \u00e2g\u00e9 pour les su\u00e9dois (58 ans), il y a seulement 12000 hommes (effet de la WGHS). Si seulement 25% des personnes sont hypertendus dans les deux \u00e9tudes am\u00e9ricaines, on monte \u00e0 68% pour la su\u00e8de, le diab\u00e8te est peu pr\u00e9valent \u00e0 l&rsquo;inclusion de 2 \u00e0 8%. Par contre il y a un gros d\u00e9s\u00e9quilibre pour les ant\u00e9c\u00e9dents familiaux de maladie coronarienne car 32% des patients su\u00e9dois ont un tel ant\u00e9c\u00e9dent contre seulement 10% pour les deux autres. Ils sont en surpoids mod\u00e9r\u00e9 avec un BMI autour de 26. Peu prennent des hypocholest\u00e9rol\u00e9miants (2 \u00e0 3%). Une large majorit\u00e9 de 75 \u00e0 90 % ne fume, ni n&rsquo;est ob\u00e8se, moins de la moiti\u00e9 ont une activit\u00e9 physique et moins de 20% mangent correctement sauf dans la WGHS (34%). Le risque g\u00e9n\u00e9tique suis une distribution normale. Le suivi m\u00e9dian est de 18,8 ans dans ARIC, 20,5 ans dans WGHS et de 19,4 ans dans MDCS.<\/p>\n<p>Avoir un score g\u00e9n\u00e9tique de risque coronarien \u00e9lev\u00e9 est associ\u00e9 \u00e0 une augmentation de 91% du risque de pr\u00e9senter un \u00e9v\u00e9nement coronarien par rapport au groupe faible. La g\u00e9n\u00e9tique a un impact fort sur le risque coronarien.<\/p>\n<p>Chaque \u00e9l\u00e9ment du style de vie r\u00e9duit de fa\u00e7on significative le risque coronarien, ne pas fumer de 44%, ne pas \u00eatre ob\u00e8se de 34%, avoir une activit\u00e9 physique de 12% et manger sain de 9%. Les courbes sont impressionnantes, avoir le mauvais billet \u00e0 la loterie g\u00e9n\u00e9tique ou faire n&rsquo;importe quoi au niveau comportemental augmente de la m\u00eame fa\u00e7on le risque coronarien.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/fig1.png\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-full wp-image-5273\" src=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/fig1.png\" alt=\"fig1\" width=\"902\" height=\"1309\" srcset=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/fig1.png 902w, https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/fig1-207x300.png 207w, https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/fig1-768x1115.png 768w, https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/fig1-706x1024.png 706w\" sizes=\"auto, (max-width: 902px) 100vw, 902px\" \/><\/a>Les auteurs ont regard\u00e9 les interactions entre la g\u00e9n\u00e9tique et les habitudes de vie. Avoir une bonne hygi\u00e8ne de vie (favorable lifestyle) r\u00e9duit de 45% le risque coronarien et ceci quelque soit votre risque g\u00e9n\u00e9tique.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/fig3.png\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-full wp-image-5274\" src=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/fig3.png\" alt=\"fig3\" width=\"1060\" height=\"555\" srcset=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/fig3.png 1060w, https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/fig3-300x157.png 300w, https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/fig3-768x402.png 768w, https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/fig3-1024x536.png 1024w\" sizes=\"auto, (max-width: 1060px) 100vw, 1060px\" \/><\/a>Vous remarquerez la coquille dans les chiffres de la WGHS dans le low genetic risk. Ces barplots sont aussi impressionnants que les courbes pr\u00e9c\u00e9dentes. Vous observerez d&rsquo;abord qu&rsquo;\u00eatre une femme est associ\u00e9e \u00e0 un risque coronarien moindre que les cohortes avec des hommes en particulier l&rsquo;ARIC, sp\u00e9ciale d\u00e9dicace <a href=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/?p=4412\">\u00e0 qui vous savez<\/a>. Ce que je trouve fascinant, c&rsquo;est qu&rsquo;avoir de mauvaises habitudes de vie m\u00eame si vous avez les bons g\u00e8nes ne vous prot\u00e8gent pas et vous avez le risque des malchanceux vertueux. On peut appeler \u00e7a du g\u00e2chis de son capital. Je trouve \u00e7a amusant dans notre soci\u00e9t\u00e9. Prendre soin de soi est une bonne chose quelques soient vos g\u00e8nes.<\/p>\n<p>Ce papier est important \u00e0 plus d&rsquo;un titre. Notre comportement a un impact sur le risque inscrit dans nos g\u00e8nes. Nos g\u00e8nes ne nous pr\u00e9destinent pas, nous ne sommes pas les agneaux offerts au couteau du bourreau g\u00e9nomique. En ne fumant pas, en faisant attention \u00e0 son poids, en ayant une activit\u00e9 physique r\u00e9guli\u00e8re et en mangeant plus de fruit, de l\u00e9gumes, moins de prot\u00e9ines, nous pouvons influer sur notre devenir. A l&rsquo;\u00e9chelon individuel, nous avons une responsabilit\u00e9.<\/p>\n<p>En terme de sant\u00e9 publique, ce travail peut poser la question de l&rsquo;int\u00e9r\u00eat de la m\u00e9decine personnalis\u00e9e. Si jouer sur les habitudes de vie a un impact quelque soit le niveau de risque g\u00e9n\u00e9tique est il bien utile de vouloir stratifier le risque de fa\u00e7on plus fine si nous n&rsquo;avons pas grand chose \u00e0 proposer. J&rsquo;attends la m\u00eame \u00e9tude avec l&rsquo;utilisation de statines guid\u00e9e sur le risque g\u00e9n\u00e9tique. Plut\u00f4t que d\u00e9penser beaucoup d&rsquo;argent \u00e0 analyser des g\u00e8nes, ne vaudrait il pas mieux le d\u00e9penser pour faire de l&rsquo;\u00e9ducation, pour lutter contre le tabagisme, l\u2019ob\u00e9sit\u00e9, la s\u00e9dentarit\u00e9, la malbouffe. Le b\u00e9n\u00e9fice d&rsquo;une telle politique serait pour tous ind\u00e9pendamment de notre individualit\u00e9 g\u00e9nomique. A l&rsquo;\u00e9chelon collectif, nous avons une responsabilit\u00e9.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/CxePCOAWgAAhkKK.jpg-large.jpg\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-full wp-image-5277\" src=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/CxePCOAWgAAhkKK.jpg-large.jpg\" alt=\"cxepcoawgaahkkk-jpg-large\" width=\"699\" height=\"554\" srcset=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/CxePCOAWgAAhkKK.jpg-large.jpg 699w, https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/CxePCOAWgAAhkKK.jpg-large-300x238.jpg 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 699px) 100vw, 699px\" \/><\/a><\/p>\n<p>Ce genre d&rsquo;articles me motive pour passer du temps \u00e0 expliquer aux personnes qui viennent me voir en consultation, l&rsquo;importance de contr\u00f4ler son poids, de faire de l&rsquo;exercice, de mieux manger, d&rsquo;arr\u00eater de fumer. R\u00e9cemment, j&rsquo;ai \u00e9t\u00e9 accus\u00e9 de ne pas comprendre qu&rsquo;il \u00e9tait mal de parler du surpoids aux patients qui viennent nous voir. Nous sommes stigmatisants, des brutes quoi. Effectivement, il est plus confortable de ne rien dire, comme de ne pas prendre la pression art\u00e9rielle, parce que c&rsquo;est connu, c&rsquo;est surfait l&rsquo;HTA. Il y a un <a href=\"http:\/\/www.thelancet.com\/journals\/lancet\/article\/PIIS0140-6736(16)31919-5\/fulltext\">milliard d&rsquo;hypertendus dans le monde<\/a>, le tensiom\u00e8tre est un truc de \u00ab\u00a0has been\u00a0\u00bb. Tellement plus simple, de juste donner un comprim\u00e9 plut\u00f4t que de parler des kilos en trop, de dire qu&rsquo;il faut faire de l&rsquo;exercice, d&rsquo;essayer de trouver le sport, chercher les raisons de l&rsquo;absence d&rsquo;amaigrissement, identifier les erreurs di\u00e9t\u00e9tiques. Tellement plus facile, de dire c&rsquo;est dans les g\u00e8nes, on peut rien y faire&#8230;<\/p>\n<p>Cet article sugg\u00e8re qu&rsquo;une attitude volontariste individuelle accompagn\u00e9e d&rsquo;une politique de sant\u00e9 publique avec de vrais moyens pour aider les individus ainsi qu&rsquo;une r\u00e9gulation de la vente du tabac, de la composition des aliments peuvent changer le destin, du moins coronarien.<\/p>\n<p>Je suis passionn\u00e9 par les r\u00e9sultats de la g\u00e9nomique contemporaine. Il est tr\u00e8s important de poursuivre l&rsquo;exploration des interactions entre nos g\u00e8nes et l&rsquo;environnement au sens large. Identifier les g\u00e8nes actionnables est essentiel. Comprendre l&rsquo;impact des SNP sur l&rsquo;expression prot\u00e9ique est capital. Il faut juste <a href=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/?p=4110\">garder en t\u00eate<\/a> que ceci ne repr\u00e9sente qu&rsquo;une partie de la complexit\u00e9 du vivant. Surtout ne vendons pas des faux r\u00eaves qui paralysent l&rsquo;action sur des choses simples comme le contr\u00f4le de la consommation du tabac, la lutte contre le surpoids qui passe par la promotion d&rsquo;une activit\u00e9 physique r\u00e9guli\u00e8re et d&rsquo;une alimentation \u00e9quilibr\u00e9e de <a href=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/?p=5259\">type m\u00e9diterran\u00e9en<\/a>.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Cet article est, \u00e0 mon sens, le plus important de l&rsquo;ann\u00e9e. Khera AV, Emdin CA, Drake I, et al. Genetic Risk, Adherence to a Healthy Lifestyle, and Coronary Disease. New England Journal of Medicine. 2016. doi:10.1056\/NEJMoa1605086. 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