{"id":5394,"date":"2017-01-15T21:32:48","date_gmt":"2017-01-15T20:32:48","guid":{"rendered":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/?p=5394"},"modified":"2017-01-15T21:32:48","modified_gmt":"2017-01-15T20:32:48","slug":"neandertal-une-victime-de-la-pollution","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/2017\/01\/15\/neandertal-une-victime-de-la-pollution\/","title":{"rendered":"N\u00e9andertal, une victime de la pollution?"},"content":{"rendered":"<p>Nous sommes des survivants, les seuls repr\u00e9sentants d&rsquo;une sous-tribu des hominin\u00e9s, <a href=\"https:\/\/fr.wikipedia.org\/wiki\/Hominina\">les hominines<\/a>. Nos fr\u00e8res homos, <a href=\"https:\/\/fr.wikipedia.org\/wiki\/Homme_de_N%C3%A9andertal#Extinction_d.27origine_infectieuse\">N\u00e9andertal<\/a>, florensis, denisovien, ont disparu entre 12000 et 30000 avant notre \u00e8re. Nous avons gard\u00e9 un peu de leur g\u00e9nome. Nous avons non seulement cohabit\u00e9 mais nous avons aussi pu nous reproduire avec eux. Pourquoi avons nous surv\u00e9cu? Cette question est vertigineuse. Que serions nous si nous devions partager le terme d&rsquo;humanit\u00e9 avec d&rsquo;autres groupes g\u00e9n\u00e9tiquement distincts? Qu&rsquo;en serait il de la question du racisme? Aurions nous une autre vision du monde? Aurait il eu des rapports de domination raciaux ? La question la plus d\u00e9rangeante reste, pourquoi ces parents si proches ont disparu ? Les aurions nous trucid\u00e9s, extermin\u00e9s, g\u00e9nocid\u00e9s?<\/p>\n<p>La pal\u00e9ontologie a fait des progr\u00e8s immenses ces derni\u00e8res ann\u00e9es gr\u00e2ce \u00e0 la g\u00e9nomique. Le s\u00e9quen\u00e7age de <a href=\"http:\/\/tuvalu.santafe.edu\/~lachmann\/papers\/Genoma_de_Neanderthal_draft_2010.pdf\">Neandertal<\/a> puis d&rsquo;un <a href=\"http:\/\/www.eva.mpg.de\/neandertal\/index.html\">d\u00e9nisovien<\/a> ont \u00e9clair\u00e9 sous un jour nouveau notre histoire. J&rsquo;ai d\u00e9couvert r\u00e9cemment l&rsquo;importance de ces travaux gr\u00e2ce aux formidables <a href=\"https:\/\/www.college-de-france.fr\/site\/jean-jacques-hublin\/_course.htm\">le\u00e7ons de Jean-Jacques Hublin<\/a> au coll\u00e8ge de France sur <a href=\"https:\/\/www.franceculture.fr\/emissions\/les-cours-du-college-de-france\/neandertals-et-denisoviens-56-jean-jacques-hublin-biologie\">France Culture<\/a>. \u00c9coutez la <a href=\"https:\/\/www.college-de-france.fr\/site\/jean-jacques-hublin\/inaugural-lecture-2014-10-08-17h00.htm\">le\u00e7on inaugurale<\/a>, vous apprendrez plein de choses et vous aurez tr\u00e8s envie d&rsquo;aller plus loin. Nous sommes une esp\u00e8ce avec un gros cerveau, pour le nourrir nous devons avoir des apports caloriques cons\u00e9quents. La cuisson des aliments a permis, en diminuant le temps de machage, en am\u00e9liorant l&rsquo;assimilation des nutriments, \u00e0 notre sous tribu d&rsquo;exploser litt\u00e9ralement en terme cognitif. La cuisson est la premi\u00e8re \u00e9tape de la digestion. Nous avons comme souvent r\u00e9ussi \u00e0 externaliser et donc \u00e0 techniciser un comportement critique. Cet ajout technique, ce proth\u00e9tisme brillant est notre pharmakon, aussi bien solution que source de probl\u00e8me.<\/p>\n<p>La cuisson des aliments n\u00e9cessite de produire de la chaleur. Le mode le plus classique est de bruler du bois. La combustion incompl\u00e8te des mati\u00e8res organiques produit des <a href=\"https:\/\/fr.wikipedia.org\/wiki\/Hydrocarbure_aromatique_polycyclique\">hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP)<\/a>. Le compos\u00e9 le plus connu est le <a href=\"https:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Benzo(a)pyrene\">benzo(a)pyr\u00e8ne<\/a> (BaP). Le BaP est un cancerig\u00e8ne. Pour \u00eatre \u00e9limin\u00e9, il doit \u00eatre transform\u00e9 par des enzymes, les CYP1, en \u00e9poxyde. Cette forme \u00e9poxyde est toxique pour l&rsquo;ADN. Il est \u00e9tonnant de constater que pour \u00e9liminer il faut passer par l&rsquo;interm\u00e9diaire d&rsquo;un produit canc\u00e9rig\u00e8ne. Le BaP active l&rsquo;expression de ses enzymes en se liant \u00e0 un facteur de transcription, Aryl Hydrocarbon Receptor (AhR).<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/bap_metabo.png\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-full wp-image-5396\" src=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/bap_metabo.png\" alt=\"\" width=\"800\" height=\"485\" srcset=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/bap_metabo.png 800w, https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/bap_metabo-300x182.png 300w, https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/bap_metabo-768x466.png 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 800px) 100vw, 800px\" \/><\/a>La capacit\u00e9 d&rsquo;AHR de lier ou de s&rsquo;activer apr\u00e8s la liaison des HAP va d\u00e9terminer le risque de biotransformation en produits toxiques comme les epoxydes. L&rsquo;activation d&rsquo;AHR a un impact sur le syst\u00e8me immunitaire, le d\u00e9veloppement, la toxicologie, l&rsquo;oncologie, la r\u00e9ponse anti-infectieuse. Une activation excessive peut entrainer des modifications physiologiques importantes. L&rsquo;\u00e9quipe de recherche, que j&rsquo;ai la chance de diriger, a montr\u00e9 que des solut\u00e9s s&rsquo;accumulant au cours la progression de l&rsquo;insuffisance r\u00e9nale chronique, les toxines ur\u00e9miques de la <a href=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/?p=1506\">famille des indoles activent AHR<\/a> au niveau de la cellule endoth\u00e9liale. Cet exc\u00e8s d&rsquo;activation entraine un \u00e9tat procoagulant et <a href=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/?p=2636\">proinflamatoire<\/a> au niveau de la paroi vasculaire, pouvant ainsi participer \u00e0 <a href=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/?p=2412\">l&rsquo;augmentation du risque cardiovasculaire<\/a> observ\u00e9 chez les patients avec une maladie r\u00e9nale chronique. Vous comprendrez mieux pourquoi un n\u00e9phrologue vous parle d&rsquo;AHR et de pal\u00e9ontologie.<\/p>\n<p>Une <a href=\"http:\/\/mbe.oxfordjournals.org\/content\/33\/10\/2648.abstract\">\u00e9quipe nord-am\u00e9ricaine<\/a>, s&rsquo;est int\u00e9ress\u00e9 aux diff\u00e9rences dans l&rsquo;exome (la phase codante de notre capital g\u00e9n\u00e9tique) entre des hominines disparus (Neandertal\/desinovien) et nous. Ils ont d\u00e9couvert que pour des paires de bases non polymorphes de notre exome, il y avait seulement 90 positions diff\u00e9rentes entre nous et nos cousins. Si on se restreint au changement entrainant une modification d&rsquo;amino-acide, on passe \u00e0 27 diff\u00e9rences, sur quelques centaines de millions de paires de bases invariantes, c&rsquo;est tr\u00e8s peu. Parmi ces 27 amino-acides changeant, un est dans AHR. Il s&rsquo;agit de la valine en position 381. Cette position est tr\u00e8s int\u00e9ressante. Elle est situ\u00e9 dans la zone de fixation des ligands d&rsquo;AHR, chez la souris la m\u00eame position n&rsquo;est pas une valine mais une alanine. AHR humain r\u00e9pond moins bien \u00e0 la stimulation par le BaP que AHR murin, il a \u00e9t\u00e9 montr\u00e9 que cette modification d&rsquo;acide amin\u00e9 joue un r\u00f4le dans cette diff\u00e9rence de r\u00e9ponse. Les hominines ancestraux portent en position 381, une alanine, comme la souris. Les auteurs ont aussi observ\u00e9s que tous les primates sauf l&rsquo;homme (homo sapiens) porte une alanine en position 381.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/AHR_neandertal.png\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-full wp-image-5398\" src=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/AHR_neandertal.png\" alt=\"\" width=\"964\" height=\"642\" srcset=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/AHR_neandertal.png 964w, https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/AHR_neandertal-300x200.png 300w, https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-content\/uploads\/2017\/01\/AHR_neandertal-768x511.png 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 964px) 100vw, 964px\" \/><\/a>Les scientifiques ont exp\u00e9rimentalement compar\u00e9 l&rsquo;activit\u00e9 de l&rsquo;AHR n\u00e9andertalien \u00e0 l&rsquo;AHR humain. Ils ont montr\u00e9 par diff\u00e9rentes approches compl\u00e9mentaires que l&rsquo;AHR ancestral en r\u00e9ponse aux HAP (BaP) active entre 150 et 1000 fois plus l&rsquo;expression des CYP1 que l&rsquo;AHR humain actuel. Par contre en r\u00e9ponse \u00e0 des ligands endog\u00e8nes comme l&rsquo;indoxyl sulfate (une toxine ur\u00e9mique), il n&rsquo;y a pas de diff\u00e9rence majeur de potentiels d&rsquo;activation des CYP1 par les diff\u00e9rents AHR.<\/p>\n<p>Cet article est passionnant \u00e0 plus d&rsquo;un titre.<\/p>\n<p>Pour ma th\u00e9matique de recherche, il veut dire que nous pouvons esp\u00e9rer identifier des inhibiteurs d&rsquo;AHR sp\u00e9cifique du ligand \u00ab\u00a0toxine ur\u00e9mique\u00a0\u00bb ne modifiant pas le potentiel de d\u00e9toxification contre des toxiques exog\u00e8nes.<\/p>\n<p>L&rsquo;hypoth\u00e8se que fait \u00e9merger ce travail est que nous avons \u00e9t\u00e9 s\u00e9lectionn\u00e9 en temps que seul survivant des homos par ce qui a fait la force de la sous tribu hominines, la maitrise du feu. Bruler du bois dans grottes devaient entrainer une accumulation importante d&rsquo;hydrocarbures aromatiques dans l&rsquo;environnement. Le fait que parmi les animaux maitrisant le feu, il a \u00e9t\u00e9 retenu \u00e0 la loterie de l&rsquo;\u00e9volution la seule (homo sapiens) qui poss\u00e8de un AHR mutant (valine 381) s&rsquo;activant moins apr\u00e8s une exposition \u00e0 des HAP est une co\u00efncidence plus que troublante. Aucun autre animal n&rsquo;a vu \u00e9merger une lign\u00e9e avec cette mutation de fa\u00e7on spontan\u00e9e dans la nature. Aucun autre animal que les homos ne sont expos\u00e9s \u00e0 la fum\u00e9e de bois. Il est tr\u00e8s tentant d&rsquo;imaginer que l&rsquo;activation d&rsquo;AHR permanente \u00e0 haut niveau par des HAP issus de la combustion du bois a \u00e9t\u00e9 responsable chez les hominines ancestraux de complications en particulier immunologique ou d\u00e9veloppementale expliquant soit une plus grande fragilit\u00e9 aux infections ou l&rsquo;apparition de malformations foetales. Homo Sapiens avec son AHR mutant pourrait alors avoir eu un avantage s\u00e9lectif d\u00e9cisif. Il le prot\u00e9geait des complications de l&rsquo;exposition aux hydrocarbures aromatiques et lui permettait de b\u00e9n\u00e9ficier avec moins de risque de l&rsquo;avantage d\u00e9cisif en terme nutritionnel de manger du cuit.<\/p>\n<p>N\u00e9andertal serait le premier hominine victime de la pollution. Il aurait du a\u00e9rer plus souvent sa grotte. Nous devrions peut \u00eatre \u00e9couter la le\u00e7on et ne pas nous croire plus malin que nos cousins disparus.<\/p>\n<p>Avec cette note, je c\u00e9l\u00e8bre <a href=\"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/?p=8\">les six ans d&rsquo;une Perruche en Automne<\/a>. Il s&rsquo;agit d&rsquo;un age respectable pour ce volatile qui a failli plusieurs fois arr\u00eater son vol. Je ne sais pas combien de temps elle battra encore des ailes en jabotant. Je remercie tous les lecteurs et les commentateurs qui sont importants pour la vie d&rsquo;un blog. Je vais garder, au d\u00e9sespoir de certains, mon \u00e9clectisme. Mes capacit\u00e9s \u00e9volutives ont des limites que je ne saurai franchir.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Nous sommes des survivants, les seuls repr\u00e9sentants d&rsquo;une sous-tribu des hominin\u00e9s, les hominines. Nos fr\u00e8res homos, N\u00e9andertal, florensis, denisovien, ont disparu entre 12000 et 30000 avant notre \u00e8re. Nous avons gard\u00e9 un peu de leur g\u00e9nome. 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