{"id":647,"date":"2011-12-19T18:35:10","date_gmt":"2011-12-19T17:35:10","guid":{"rendered":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/?p=647"},"modified":"2011-12-19T18:35:10","modified_gmt":"2011-12-19T17:35:10","slug":"genetique-et-risque-de-developper-une-insuffisance-renale-chronique-pas-devidence","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/2011\/12\/19\/genetique-et-risque-de-developper-une-insuffisance-renale-chronique-pas-devidence\/","title":{"rendered":"G\u00e9n\u00e9tique et risque de d\u00e9velopper une insuffisance r\u00e9nale chronique, pas d’\u00e9vidence"},"content":{"rendered":"

La m\u00e9decine personnalis\u00e9e reposant sur l’analyse des facteurs de risque g\u00e9n\u00e9tiques (SNP en particulier) est un grand espoir de l’industrie biom\u00e9dicale. De multiples acteurs sont sur les rangs. Big pharma qui veux vendre des packages complets, identification de mutations et la drogue ciblant l’anomalie. Des pures players comme 23andMe, decode et consorts qui aimeraient capter le march\u00e9 de la pr\u00e9diction tout venant. Ils proposent d\u00e9j\u00e0 ces services sans aucun rationnel. Il y a quelques ann\u00e9es, j’avais post\u00e9 sur le sujet<\/a>. La situation n’a pas chang\u00e9 et plus nos connaissances avancent moins nous sommes capables de pr\u00e9dire quoi que ce soit en lisant des SNPs.<\/p>\n

Je vais prendre l’exemple d’un excellent article<\/a> qui vient d’\u00eatre publi\u00e9 dans AJKD.<\/p>\n

    \n
  1. Conall M. O\u2019Seaghdha et al., \u00ab\u00a0Performance of a Genetic Risk Score for CKD Stage 3 in the General Population\u00a0\u00bb, American Journal of Kidney Diseases<\/em> 59, no<\/sup>. 1 (janvier 2012): 19-24.<\/li>\n<\/ol>\n

    Les auteurs ont tent\u00e9 de savoir si l’ajout de l’\u00e9tude de SNPs, connus pour \u00eatre associ\u00e9s au risque de d\u00e9velopper une insuffisance r\u00e9nale chronique stade 3<\/a>, \u00e0 un score clinique am\u00e9liore la pr\u00e9diction du risque d’\u00eatre insuffisant r\u00e9nal. Ils ont utilis\u00e9 la cohorte de framingham (2489 personnes d’origine europ\u00e9enne) avec un suivi de plus de 10 ans. 10% de la cohorte aura d\u00e9velopp\u00e9 une maladie r\u00e9nale chronique stade 3 \u00e0 la derni\u00e8re visite. Le score clinique (age, sexe,\u00a0 eGFR, hypertension, diab\u00e8te, et prot\u00e9inurie) permet de tracer une courbe ROC correcte, l’ajout des 16 SNP n’apporte rien.<\/p>\n

    \"\"<\/a>Ce travail est fondamental. Il montre que pour l’instant les marqueurs g\u00e9nomiques dont nous nous gargarisons n’apportent strictement rien en pratique clinique. Si tant est qu’il soit utile de d\u00e9terminer le risque d’\u00eatre insuffisant r\u00e9nal chronique stade 3 \u00e0 10 ans. C’est un autre sujet.<\/p>\n

    Il ne faut pas renoncer \u00e0 identifier des facteurs de risque g\u00e9n\u00e9tiques mais il faut rester d’une grande humilit\u00e9 et savoir si en terme \u00e9conomique, ils am\u00e9liorent le rendement des marqueurs cliniques simples. Une fois que nous poss\u00e9derons ces marqueurs g\u00e9nomiques qui am\u00e9lioreront l’\u00e9valuation du risque, il faudra d\u00e9terminer si leur utilisation permet d’am\u00e9liorer la prise en charge des patients et si il d\u00e9gage un b\u00e9n\u00e9fice autre que de constater qu’on \u00e0 plus de chance de mourir dans les dix ans quand on a 80 ans que 25 ans.<\/p>\n

    Je ne peux que vous conseiller la lecture de l’\u00e9ditorial<\/a> qui accompagne l’article.<\/p>\n

      \n
    1. Jeffrey B. Kopp et Cheryl A. Winkler, \u00ab\u00a0Genetic Risk Prediction for CKD: A Journey of a Thousand Miles\u00a0\u00bb, American Journal of Kidney Diseases<\/em> 59, no<\/sup>. 1 (janvier 2012): 4-8.<\/li>\n<\/ol>\n

      Il fait un point remarquable sur le sujet de l’apport de la g\u00e9nomique dans la pr\u00e9diction du risque dans des maladies fr\u00e9quentes. Le r\u00e9sultat est peu glorieux. Comme le disent les auteurs, la route est encore longue et nous ne sommes qu’au d\u00e9but du chemin.<\/p>\n

      Dans la m\u00eame livraison d’AJKD, un article s’int\u00e9resse<\/a> \u00e0 l’impact des ant\u00e9c\u00e9dents familiaux d’insuffisance r\u00e9nale chronique terminale sur le risque de d\u00e9velopper une IRCT.<\/p>\n

        \n
      1. William M. McClellan et al., \u00ab\u00a0Association of Family History of ESRD, Prevalent Albuminuria, and Reduced GFR With Incident ESRD\u00a0\u00bb, American Journal of Kidney Diseases<\/em> 59, no<\/sup>. 1 (janvier 2012): 25-31.<\/li>\n<\/ol>\n

        Ce facteur de risque quand on l\u2019int\u00e8gre dans des mod\u00e8les multivari\u00e9s en particulier avec un eGFR ou la prot\u00e9inurie, n’est plus un facteur de risque.<\/p>\n

        Le terrain g\u00e9n\u00e9tique est important mais il ne peut pas seul, d\u00e9terminer ce que nous deviendrons du moins au niveau r\u00e9nal. C’est rassurant. Nous poss\u00e9dons encore une part de libre arbitre vis \u00e0 vis de nos g\u00e8nes. Le domaine de la g\u00e9nomique pr\u00e9dictive n’est qu’\u00e0 ses d\u00e9buts et ce n’est pas demain que nous pourrons pr\u00e9dire le risque d’un individu \u00e0 sa naissance de devenir insuffisant r\u00e9nal (hors maladie mong\u00e9nique de transmission mend\u00e9lienne et encore).<\/p>\n

        Quand je vois ces r\u00e9sultats, je suis dubitatif sur les promesses des soci\u00e9t\u00e9s sus cit\u00e9es. Elles font un travail int\u00e9ressant. En accumulant des donn\u00e9es, elles vont faire progresser la recherche, si les donn\u00e9es sont mises en commun. Nous verrons bien. Nous rentrons dans l\u2019\u00e8re du big data en m\u00e9decine.<\/p>\n

        Je finirai en vous faisant remarquer que l’article qui a identifi\u00e9 les SNP a \u00e9t\u00e9 publi\u00e9 dans nature genetics (gros impact factor) alors que cet article qui est l’utilisation et la d\u00e9monstration que \u00e7a ne sert pas \u00e0 grand chose en pratique clinique ne se retrouve que dans AJKD. C’est attristant. Pour la pratique du m\u00e9decin de base que je suis, l’article dans la revue avec IF \u00e0 4 est bien plus important que l’autre. Il sera moins cit\u00e9, il marquera moins les esprits sauf des sp\u00e9cialistes alors que l’autre par son impact plus g\u00e9n\u00e9ralistes et le prestige de la revue sera ressorti \u00e0 tout bout de champs. Je trouve \u00e7a \u00e9nervant.<\/p>\n

        Il y a 10 ans, le g\u00e9nome humain \u00e9tait compl\u00e9tement s\u00e9quenc\u00e9, dix ans plus tard, nous ne savons toujours pas utiliser ces donn\u00e9es. Un outil hautement technologique ne fait pas mieux qu’une pauvre bandelette urinaire. La revanche du simple sur le complexe. J’aime bien.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

        La m\u00e9decine personnalis\u00e9e reposant sur l’analyse des facteurs de risque g\u00e9n\u00e9tiques (SNP en particulier) est un grand espoir de l’industrie biom\u00e9dicale. De multiples acteurs sont sur les rangs. Big pharma qui veux vendre des packages complets, identification de mutations et … Continuer la lecture →<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"jetpack_post_was_ever_published":false,"_jetpack_newsletter_access":"","_jetpack_dont_email_post_to_subs":false,"_jetpack_newsletter_tier_id":0,"_jetpack_memberships_contains_paywalled_content":false,"_jetpack_memberships_contains_paid_content":false,"footnotes":"","jetpack_publicize_message":"","jetpack_publicize_feature_enabled":true,"jetpack_social_post_already_shared":false,"jetpack_social_options":{"image_generator_settings":{"template":"highway","default_image_id":0,"font":"","enabled":false},"version":2}},"categories":[13,14,61],"tags":[80,136,322,324,325,323],"class_list":["post-647","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-medecine-2","category-nephrologie","category-science","tag-famille","tag-genomique","tag-maladie-renale-chronique","tag-prediction","tag-risque","tag-snp"],"jetpack_publicize_connections":[],"jetpack_featured_media_url":"","jetpack_shortlink":"https:\/\/wp.me\/p1l1zM-ar","jetpack_sharing_enabled":true,"jetpack-related-posts":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/647","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=647"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/647\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":651,"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/647\/revisions\/651"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=647"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=647"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/perruchenautomne.eu\/wordpress\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=647"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}